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 基因芯片与siRNA干扰技术结合实例
  如果想研究某一生物学通路的基因的表达状况,使用针对该类基因的功能分类基因芯片比使用高密度表达谱芯片更加有效便利。siRNA是一种新型有力的研究工具,可以体外特异性关闭目的基因的转录。 最近Perissi和他的同事们结合运用功能分类基因芯片和siRNA方法,证明了TBL1/TBLR1参与NFkB信号通路。
  TBL1/TBLR1作为两种F box/WD-40因子,最初被认为是N-CoR辅抑制物复合体的组成部分。然而, 在Perissi和他的同事们发表在Cell上的文章中,他们发现核受体介导的转录激活需要这两种因子的参与。
  在他们的实验中,作者用SuperArray公司的NFkB信号通路基因芯片(货号:MM-016)分析NFkB转录激活中是否需要TBL1/TBLR1的参与。RNA样品取自500个实验细胞,实验显示, 当用合成的基因特异性siRNA将TBL1或者TBLR1敲除后,由TNFa 刺激导致的所有NFkB靶基因的激活便不再发生。

图 2:用小鼠NFkB信号通路基因芯片所得到的基因表达状况之比较。
   样品A来自未经处理的HUVEC细胞
   样品B来自经TNFa刺激的 HUVEC细胞
   样品C来自经TNFa刺激又经Tbl1 siRNA作用的HUVEC细胞
   样品D来自经TNFa刺激又经 Tb1R1 siRNA作用的HUVEC细胞

 
Reference:
  1、Perissi V, Aggarwal A, Glass CK, Rose DW and Rosenfeld MG. (2004) A Corepressor/Coactivator Exchange Complex Required for Transcriptional Activation by Nuclear Receptors and Other Regulated Transcription Factors. Cell 116, 511-526

mRNA
产品信息
全基因组表达谱基因芯片
SABiosciences第二代功能分类基因芯片简介
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