康成Functional LncRNA PCR芯片服务数据分析流程1. PCR芯片数据质控质控参数:Ct(Blank)>35; Ct(GDC)>35; Ct(RNA Spike-in)<25; Ct (PPC) <25. 符合上述条件的样本进入下一步分析。数据QC结果见Arraystar服务报告。2. 数据校正与△Ct值计算板间校正:使用Ct(PPC)对不同PCR板进行板间校正。内参校正与△Ct值计算:挑选最优内参,使用内参均值计算△Ct值。3. 差异倍数计算 (2^(-△△Ct))使用 △△Ct 方法计算不同样品组之间的表达差异倍数。4. P值计算对样本组进行t检验,计算P值。5. 其他常规数据分析散点图分析;火山图分析;TOP20表达上调和下调LncRNA柱形图分析6. 提供服务报告与数据分析结果a. Arraystar服务报告(包括RNA样本QC、qPCR数据QC和详细实验数据分析步骤)b. Excel芯片结果汇总表(包括tRNA列表,数据分析结果和各类图表)c. Raw Data文件夹 (包含原始数据、扩增曲线图和熔解曲线图)
康成Functional LncRNA PCR芯片服务部分数据分析结果展示1. 差异表达LncRNA列表(默认筛选参数:差异倍数>2;P<0.05,客户可指定筛选参数值)2. 散点图 (黑色斜线代表差异倍数为1,红色斜线代表差异倍数为2)差异表达3. 火山图(黑色垂线代表差异倍数为1;粉色垂线代表上调或下调倍数为2;蓝色水平线代表P值为0.05)4. TOP20表达上调LncRNA柱状图5. TOP20表达下调LncRNA柱状图