康成生物为您提供全基因组表达谱芯片技术服务,您只需要提供保存完好的组织或细胞标本,康成的芯片技术服务人员就可为您完成全部实验操作,并提供完整的实验报告。
Agilent全基因组表达谱芯片
Agilent公司的原位喷墨专利技术(SurePrint)可以实现在1"x 3"的玻璃片基上灵活地、大规模地原位合成60mer的寡核苷酸探针,该技术可以很快很灵活地响应并实现最新的芯片探针设计方案,使研究者及时得到高质量的、最新的芯片,作为研究基因表达变化的利器。
每个芯片探针的设计除了经过软件考虑其Tm、二级结构、序列特异性等之外,还都要经反复实验筛选优化以得到灵敏度和精确度更高、重复性更好的结果。2006年美国FDA发表的现主流芯片平台评估报告MAQC中,Agilent array 的结果与 Taqman array 结果的重复性最高。在国际论文期刊上,也有很多利用Agilent array 平台发表的高质量文章,具体请参阅Agilent 网站。
目前提供的芯片有人、小鼠、大鼠的全基因组表达芯片,每个物种覆盖的基因超过41000个,探针设计综合参考了各种公共数据库,是经过实验验证的经典设计方案。
Agilent表达谱芯片产品列表
芯片名称 |
种属 |
格式 |
基因数 |
Database source |
Whole human genome |
人 |
4 x 44K |
~41,000 |
Goldenpath, Ensembl, Unigene, Human Genome (Build 33), Refseq, GebBank |
whole mouse genome |
小鼠 |
4 x 44K |
~41,000 |
USC mRNA known genes, Natl. Institute on Aging, Genbank, Unigene, Refseq, Ensembl, RIKEN |
whole rat genome |
大鼠 |
4 x 44K |
~41,000 |
Ensembl, UCSC Goldenpath, Unigene, Refseq, Genbank |
SurePrint G3 Human Gene Expression 8x60K v2 Microarray |
人 |
8 x 60 K |
~50,000 |
RefSeq, Ensemble, Unigene, GenBank,
Broad Institute Human lincRNA and TUCP catalog |
SurePrint G3 Mouse GE 8x60K Microarray |
小鼠 |
8 x 60 K |
~40,000 |
RefSeq, Ensembl, Unigene, GenBank, RIKEN |
SurePrint G3 Rat GE 8x60K Microarray |
大鼠 |
8 x 60 K |
~30,000 |
RefSeq, Ensembl,Unigene, GenBank |
Agilent还提供多类物种的表达谱芯片 动物:兔、猪、斑马鱼、果蝇等 植物:水稻、玉米、拟南芥、烟草等 微生物:大肠杆菌、酵母等
Agilent表达谱芯片特点 ● 原位喷墨合成技术:原位合成的探针使得芯片平台具有极高的稳定性,喷墨合成技术可以大规模、灵活地合成探针,为客户提供最新的芯片设计。 ● 60mer的长探针:与短探针相比,具有更高的信噪比、灵敏度和特异性。 ● 权威公认:2006年美国FDA发表的主流芯片平台评估报告MAQC中,Agilent array 的C-V值、检测基因数目、与Taqman探针的重复性均处于国际同行业领先水平。
Agilent 芯片技术示意图
A. 客户提供实验组(Exp)、对照组(Control)样本或Total RNA;
B. 使用Nanodrop测定RNA 在分光光度计260nm 、280nm和230nm的吸收值,以计算浓度并评估纯度;
C. cDNA放大及荧光标记,实验组(Cy5),对照组(Cy3);
D. 进行芯片杂交及洗脱等步骤;
E. 进行图像扫描及数据分析。 |